OpenCravat: Otevření vlastní seřazené analýzy sady variant toolkit

  • Článek

OpenCRAVAT je balíček Pythonu, který provádí interpretaci genomické varianty, včetně dopadu variant, poznámek a bodování. OpenCRAVAT využívá modulární architekturu se širokou škálou analytických modulů a anotačních prostředků, které je možné vybrat a nainstalovat/spustit na základě potřeb konkrétní studie.

Další informace o datech najdete v tématu OpenCravat.

Poznámka:

Microsoft poskytuje datové sady Azure Open Datasets na bázi "tak, jak je". Společnost Microsoft neposkytuje žádné záruky, výslovné ani předpokládané záruky ani podmínky týkající se vašeho používání datových sad. V rozsahu povoleném vaším místním zákonem společnost Microsoft odmítá veškerou odpovědnost za případné škody nebo ztráty, včetně přímých, následných, zvláštních, nepřímých, náhodných nebo represivních, vyplývajících z vašeho používání datových sad.

Na tuto datovou sadu se vztahují původní podmínky, které Microsoft přijal se zdrojovými daty. Datová sada může obsahovat data pocházející z Microsoftu.

Zdroj dat

Tato datová sada je zrcadlem úložiště na https://store.opencravat.org a https://run.opencravat.org.

Objemy dat a frekvence aktualizací

Tato datová sada obsahuje 500 GB dat a aktualizuje se každý den.

Umístění úložiště

Tato datová sada se uchovává v těchto oblastech Azure: USA – středozápad a USA – západ 2. Kvůli přidružení se doporučuje přidělovat výpočetní prostředky v oblasti USA – středozápad nebo USA – západ 2.

Přístup k datům

USA – západ 2: 'https://datasetopencravat.blob.core.windows.net/dataset'

USA – středozápad: 'https://datasetopencravat-secondary.blob.core.windows.net/dataset'

Token SAS: sv=2020-04-08&st=2021-03-11T23%3A50%3A01Z&se=2025-07-26T22%3A50%3A00Z&sr=c&sp=rl&sig=J9J9wnJOXsmEy7TFMq9wjcxjXDE%2B7KhGpCUL4elsC14%3D

Podmínky použití

OpenCRAVAT je k dispozici s licencí GPLv3. Většina zdrojů dat je zdarma k nekomerčnímu využití. V případě komerčního využití konzultujte institucionální kontakty pro příslušný zdroj dat.

Kontakt

rkarchi1@jhmi.edu

Další kroky

Prohlédněte si zbývající datové sady v katalogu Open Datasets.