GloWGR: GesamtgenomregressionGloWGR: Whole genome regression

Glowgr ist eine skalierbare gesamte Genom Regressions Methode, die in Zusammenarbeit mit dem Regeneron Genetics Center in Open Source mit Project Glanzentwickelt wurde.GloWGR is a scalable whole genome regression method developed in collaboration with the Regeneron Genetics Center in open source with Project Glow. Glowgr ist eine verteilte Version des Tools mit einem einzelnen Knoten (Weitere Informationen finden Sie in der zweiten Version von biorxiv Preprint).GloWGR is a distributed version of the single-node tool regenie (see the second version of the bioRxiv preprint). Glowgr ist ein für Unternehmen bereites Tool, das eine äquivalente Genauigkeit gegenüber anderen Methoden für die gesamte Genom Regression bietet, aber mit einer Größen Verbesserung der Geschwindigkeit.GloWGR is an enterprise-ready tool that provides equivalent accuracy to other methods for whole genome regression, but with an order-of-magnitude improvement in speed.

Erstellen eines GloWGR-ClustersCreate a GloWGR cluster

Führen Sie glowgr in Databricks Runtime 7,0 für Genomics und höher aus.Run GloWGR in Databricks Runtime 7.0 for Genomics and above.

  • Für die Cluster Konfiguration sollte Databricks Runtime für Genomicsverwendet werden.The cluster configuration should use Databricks Runtime for Genomics.
  • Verwenden Sie für eine optimale Leistung die Speicher optimierten VMS.For best performance, use the storage-optimized VMs. Wir empfehlen Standard_L16s_v2.We recommend Standard_L16s_v2.

Notebook mit BeispielenExample notebook

Glowgr-NotebookGloWGR notebook

Notebook abrufenGet notebook