GloWGR : Régression totale du génomeGloWGR: Whole genome regression

GloWGR est une méthode de régression de génome entière évolutive développée en collaboration avec le Centre de génétique Regeneron dans Open source avec un éclat de projet.GloWGR is a scalable whole genome regression method developed in collaboration with the Regeneron Genetics Center in open source with Project Glow. GloWGR est une version distribuée de l’outil à nœud unique regenie (voir la deuxième version de la préimpression bioRxiv).GloWGR is a distributed version of the single-node tool regenie (see the second version of the bioRxiv preprint). GloWGR est un outil adapté à l’entreprise qui offre une précision équivalente à d’autres méthodes pour la régression du génome entier, mais avec une amélioration de l’ordre de grandeur de la vitesse.GloWGR is an enterprise-ready tool that provides equivalent accuracy to other methods for whole genome regression, but with an order-of-magnitude improvement in speed.

Créer un cluster GloWGRCreate a GloWGR cluster

Exécutez GloWGR dans Databricks Runtime 7,0 pour génomique et versions ultérieures.Run GloWGR in Databricks Runtime 7.0 for Genomics and above.

  • La configuration du cluster doit utiliser Databricks Runtime pour la génomique.The cluster configuration should use Databricks Runtime for Genomics.
  • Pour de meilleures performances, utilisez les machines virtuelles optimisées pour le stockage.For best performance, use the storage-optimized VMs. Nous vous recommandons de Standard_L16s_v2.We recommend Standard_L16s_v2.

Exemple de bloc-notesExample notebook

Bloc-notes GloWGRGloWGR notebook

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