Genomics の Databricks Runtime 6.5 (サポートされていません)Databricks Runtime 6.5 for Genomics (Unsupported)

Databricks は2020年4月にこのイメージをリリースしました。Databricks released this image in April 2020.

Databricks Runtime 6.5 for Genomics は、ゲノムと生体データを操作するために最適化された Databricks Runtime 6.5 (サポートされていない) の一種です。Databricks Runtime 6.5 for Genomics is a variant of Databricks Runtime 6.5 (Unsupported) optimized for working with genomic and biomedical data. これは、Genomics 用の Databricks 統合分析プラットフォームのコンポーネントです。It is a component of the Databricks Unified Analytics Platform for Genomics.

Genomics クラスターの Databricks Runtime を作成する手順など、詳細については、 Genomics の「Databricks Runtime」を参照してください。For more information, including instructions for creating a Databricks Runtime for Genomics cluster, see Databricks Runtime for Genomics. Genomics アプリケーションの開発の詳細については、「 genomics guide」を参照してください。For more information on developing genomics applications, see Genomics guide.

新機能New features

Databricks Runtime 6.5 for Genomics は Databricks Runtime 6.5 の上に構築されています。Databricks Runtime 6.5 for Genomics is built on top of Databricks Runtime 6.5. Databricks Runtime 6.5 の新機能の詳細については、 Databricks Runtime 6.5 (サポートされていません) リリースノートを参照してください。For information on what’s new in Databricks Runtime 6.5, see the Databricks Runtime 6.5 (Unsupported) release notes.

機能強化Improvements

0.2.33 より前のバージョンでは、ユーザーが同じクラスターで複数のノート pc を実行できないようにするバグが ありましたPrior to version 0.2.33, Hail had a bug that prevented users from running multiple Hail notebooks on the same cluster. オープンソースでこの 問題 を解決し、インストールされているバージョンを更新しました。We resolved this issue in open source and updated the installed version of Hail.

ライブラリLibraries

Databricks Runtime 6.5 に含まれる次のライブラリは、Databricks Runtime 6.5 に含まれているものとは異なります。The following libraries included in Databricks Runtime 6.5 for Genomics differ from those included in Databricks Runtime 6.5.

ライブラリLibrary VersionVersion
ADAMADAM 0.30.00.30.0
Hadoop-bamHadoop-bam 7.9.27.9.2
ひょうHail 0.2.330.2.33
GATKGATK 4.0.11.04.0.11.0
samtoolssamtools 1.91.9
VEPVEP 9696