DICOM 서비스를 사용하는 디지털 병리학

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병리학은 주로 질병의 원인, 기원 및 본질에 관한 의학 분야입니다. 그것은 질병을 공부하고 진단하기 위하여 조직, 기관, 체액 및 부검의 검사를 관련시킵니다.

역사적으로, 조직의 바이오 유리 슬라이드에 저장되고 현미경으로 조사됩니다. 이것은 임상의와 병리학자들이 연구뿐만 아니라 상담 및 진단에 대한 정보를 공유해야 할 때 도전을 만듭니다.

디지털 이미징은 랩 외부에서 이미지 공유, AI/ML 모델 학습 및 장기 스토리지를 지원하는 방법으로 병리학 분야에서 점점 더 인기를 끌고 있습니다. 이 변환은 현미경 슬라이드를 디지털화하기 위한 계측기의 상업적 가용성에 의해 촉진됩니다.

오늘날 디지털 병리 스캐너는 일반적으로 이미징을 독점 형식으로 출력합니다. 이렇게 하면 공유 및 AI/ML 모델 학습이 복잡해지며 디지털화의 많은 장점이 무뚝뚝합니다. 이러한 변환을 용이하게 하기 위해 많은 조직에서 WSI(전체 슬라이드 이미징) 디지털 슬라이드를 DICOM 표준 형식으로 변환하기 시작했습니다. 이러한 이미지가 DICOM® 형식이 되면 이러한 이미지는 상업적으로 사용 가능한 PACS 시스템에 저장할 수 있으며, 방사선 전문의가 수십 년 동안 완성한 도구와 프로세스를 사용하여 관리할 수 있습니다.

디지털 병리학을 위한 DICOM 서비스

DICOM 서비스는 다음과 같은 고유한 디지털 병리학 요구 사항을 지원합니다.

  1. 크기가 여러 GB인 경로 DICOM 인스턴스를 업로드하는 데 필요한 크기 조정 및 성능입니다.
  2. 빠른 프레임 액세스를 통해 웹 뷰어가 지연 또는 흐림 없이 DICOM 병리학 이미지를 원활하게 이동 및 확대/축소할 수 있습니다.
  3. 보관 및 연구 사용을 위한 장기 사후 진단을 이미지를 저장하는 비용 효율적인 방법입니다.

Diagram showing whole-slide imaging digitization and cloud storage.

디지털화

DICOM 표준은 이제 WSI(전체 슬라이드 이미지)를 지원하지만 많은 취득 스캐너는 DICOM 형식으로 이미지를 캡처하지 않습니다. DICOM 서비스는 DICOM 형식의 이미지만 지원하므로 다른 형식의 WSI에는 형식 변환이 필요합니다. 이러한 형식 변환을 수행하기 위한 몇 가지 상용 및 오픈 소스 솔루션이 있습니다.

다음은 사용자 고유의 변환기를 빌드하는 도구에 오픈 소스 몇 가지 샘플입니다.

스토리지

변환된 각 WSI는 여러 인스턴스가 있는 DICOM 시리즈를 생성합니다.

일괄 업로드

업로드해야 하는 더 큰 크기 및 인스턴스 수를 고려할 때 가져오기를 사용하여 각 계열의 일괄 업로드 또는 변환된 WSI 일괄 처리를 사용하는 것이 좋습니다.

스트리밍 업로드

각 파일을 변환할 때 업로드하려는 경우 아래와 같이 STOW 단일 파트 요청을 사용할 수 있습니다.

필수 조건

curl -X POST \
    -H "Content-Type: application/dicom" \
    -H "Authorization: Bearer {token}" \
    -H "Accept: application/dicom+json" \
{service-url}/{version}/studies \
    --data-binary {dcmFile}.dcm

몇 초 만에 수십 개의 GB 업로드 지원을 테스트했습니다.

검색

뷰어는 DICOM 인스턴스에 프레임으로 저장된 타일을 검색합니다. 각 DICOM 인스턴스에는 여러 프레임이 포함될 수 있습니다. 성능 향상을 위해 병렬 단일 파트 GET 프레임을 사용하는 것이 좋습니다.

필수 조건

curl -X GET \
    -H "Authorization: Bearer {token}" \
    -H "Accept: application/octet-stream; transfer-syntax=*" \
{service-url}/{version}/studies/{studyInstanceUid}/series/{seriesInstanceUid}/instances/{sopInstanceUid}/frames/{frameNumber} \
    --output {fileName}

클라이언트에서 약 60-70ms에서 60Kb 타일의 지원 다운로드를 테스트했습니다 .

뷰어

DICOMWeb 서비스 및 OIDC 인증으로 구성할 수 있는 모든 WSI 뷰어를 사용하는 것이 좋습니다.

샘플 오픈 소스 뷰어

뷰어가 DICOM 서비스와 직접 상호 작용하는 경우 CORS 지침을 따릅니다.

ISV 파트너 찾기

엔드 투 dicom-support@microsoft.com 엔드 솔루션 및 지원을 제공하는 파트너 ISV와 협력하려는 경우 연락하세요.

다음 단계

Azure에서 DICOM 서비스 배포

DICOM 서비스와 함께 DICOMweb API 사용

참고 항목

DICOM® 은 의료 정보의 디지털 통신과 관련된 표준 간행물에 대한 전국 전기 제조 업체 협회의 등록 상표입니다.