Databricks Runtime 6.5 para Genómica (Não suportado)

Databricks divulgou esta imagem em abril de 2020.

Databricks Runtime 6.5 for Genomics é uma variante do Databricks Runtime 6.5 (Não suportado) otimizado para trabalhar com dados genômicos e biomédicos. É um componente da Plataforma de Análise Unificada de Databricks para a Genómica.

Para obter mais informações, incluindo instruções para a criação de um intervalo de runtime databricks para genómica, consulte Databricks Runtime for Genomics (Deprecated). Para obter mais informações sobre o desenvolvimento de aplicações genómicas, consulte o guia Gennomics.

Novas funcionalidades

Databricks O tempo de execução 6.5 para genómica é construído em cima do Databricks Runtime 6.5. Para obter informações sobre as novidades em Databricks Runtime 6.5, consulte as notas de lançamento databricks Runtime 6.5 (Não suportadas).

Melhorias

Antes da versão 0.2.33, Hail tinha um bug que impedia os utilizadores de executar vários cadernos Hail no mesmo cluster. Resolvemos esta questão em código aberto e atualizámos a versão instalada do Hail.

Bibliotecas

As seguintes bibliotecas incluídas no Databricks Runtime 6.5 para Genómica diferem das incluídas no Databricks Runtime 6.5.

Biblioteca Versão
ADÃO 0.30.0
Hadoop-bam 7.9.2
Granizo 0.2.33
GATK 4.0.11.0
samtools 1.9
VEP 96