OpenCravat: открытый пользовательский анализ вариантов набор средств

  • Статья

OpenCRAVAT — это пакет Python, который выполняет интерпретацию геномных вариантов, включая влияние вариантов, аннотацию и оценку. OpenCRAVAT имеет модульную архитектуру с широким спектром модулей анализа и ресурсов аннотации, которые можно выбрать и установить или запустить в зависимости от потребностей того или иного исследования.

Дополнительные сведения о данных см. на сайте OpenCravat.

Примечание.

Корпорация Майкрософт предоставляет Открытые наборы данных Azure как есть. Корпорация Майкрософт не предоставляет никаких гарантий (явных или подразумеваемых) и не определяет никаких условий в связи с использованием этих наборов данных. В рамках, допускаемых местным законодательством, корпорация Майкрософт отказывается от ответственности за ущерб и убытки (в том числе прямые, косвенные, специальные, опосредованные, случайные и штрафные), понесенные в результате использования вами этих наборов данных.

Этот набор данных предоставляется на тех же условиях, на которых корпорация Майкрософт получила исходные данные. Этот набор может включать данные, полученные от корпорации Майкрософт.

Источник данных

Этот набор данных является зеркалом хранилища по адресу https://store.opencravat.org и https://run.opencravat.org

Объемы данных и частота обновления

Этот набор данных содержит примерно 500 ГБ данных и обновляется ежедневно.

Расположение хранилища

Этот набор данных хранится в регионах Azure "Западная часть США 2" и "Центрально-западная часть США". Для обеспечения приближенности рекомендуется выделять вычислительные ресурсы в регионе "Западная часть США 2" или "Центрально-западная часть США".

Доступ к данным

Западная часть США 2: https://datasetopencravat.blob.core.windows.net/dataset

Центрально-западная часть США: https://datasetopencravat-secondary.blob.core.windows.net/dataset

Маркер SAS: sv=2020-04-08&st=2021-03-11T23%3A50%3A01Z&se=2025-07-26T22%3A50%3A00Z&sr=c&sp=rl&sig=J9J9wnJOXsmEy7TFMq9wjcxjXDE%2B7KhGpCUL4elsC14%3D

Условия использования

Набор данных OpenCRAVAT предоставляется по лицензии GPLv3. Большинство источников данных предоставляются бесплатно для некоммерческого использования. По вопросам коммерческого использования проконсультируйтесь с контактными лицами соответствующих учреждений по каждому источнику данных.

Контакт

rkarchi1@jhmi.edu

Следующие шаги

Ознакомьтесь с другими наборами в каталоге Открытых наборов данных.