Genomiks Data Lake

  • Makale

Genomiks Data Lake, ücretsiz olarak erişebileceğiniz ve genomiks analizi iş akışlarınızla uygulamalarınızla tümleştirebileceğiniz çeşitli genel veri kümeleri sağlar. Veri kümelerinde BAM, FASTA, VCF ve CSV dosya biçimlerindeki genom dizileri, değişkenlik bilgisi ve konu/örnek meta verileri bulunur.

Genomiks Veri Gölü, Batı ABD 2 ve Orta Batı ABD Azure bölgelerinde barındırılır. Benzeşim için Batı ABD 2 ve Orta Batı ABD'de işlem kaynakları ayrılması önerilir.

Not

Veri kümelerinin kullanımı, veri kümesi sahipleri tarafından belirlenen hüküm ve koşullara tabidir. Geçerli hüküm ve koşullar için her veri kümesinin ayrıntılar sayfasına bakın.

Veri kümeleri

Veri kümeleri Description
Illumina Platinum Genomları Illumina Platinum Genomları
İnsan Başvuru Genomları İnsan Başvuru Genomları
ClinVar Ek Açıklamaları ClinVar Ek Açıklamaları
SnpEff SnpEff: Genomik değişkenlere yönelik ek açıklamalar ve işlevsel etki tahmini araç kutusu
gnomAD gnomAD: Genom Toplama Veritabanı
1000 Genom 1000 Genom
OpenCravat OpenCravat: Varyant Araç Setinin Özel Derecelendirilmiş Analizini Açma
KODLAMAK ENCODE: DNA Öğeleri Ansiklopedisi
GATK Kaynak Paketi GATK Kaynak paketi
TCGA Açık Veri TCGA Açık Veri
Pan UK-Biobank Kaydırma UK-Biobank

Sonraki adımlar

Açık Veri Kümeleri kataloğundaki diğer veri kümelerini görüntüleyin.