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編碼:DNA 元素的百科全書

DNA元素(ENCODE)聯合會的百科全書是國家人類基因組研究所(NHGRI)資助的研究小組正在進行的國際合作。 ENCODE 的目標是在人類基因組中建立功能元素的完整部分清單,包括在蛋白質和RNA水準上作用的元素,以及控制基因作用中細胞和情況的監管元素。

ENCODE 調查人員採用各種檢測和方法來識別功能元素。 基因元素的探索與註釋主要會透過定序各種不同的 RNA 來源、比較基因組、綜合生物資訊方法,以及人力彙整完成。 監管元素通常通過DNA超敏感檢測、DNA甲基化檢測和與DNA和RNA互動的蛋白質免疫分析(IP)進行調查,即修改了他的蛋白、轉錄因數、色蛋白調節器和RNA系結蛋白質,然後進行排序。

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資料來源

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資料量和更新頻率

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儲存位置

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無論類型或大小為何,外部數據使用者都可根據任何 ENCODE 數據自由下載、分析及發佈結果,而不論類型或大小為何,都不包含編碼數據產生者的寬限期,無論是作為個別成員或聯盟的一部分。 鼓勵使用未發佈的 ENCODE 數據的研究人員與數據產生者聯繫,討論可能的出版物。 聯盟會以獨立出版物的方式,持續發佈自身分析作業的結果。

針對在出版物及簡報中使用 ENCODE 資料集 (不論是否已發佈) 的研究員,ENCODE 要求以 https://www.encodeproject.org/help/citing-encode/ 中所述的方式註明出處為 ENCODE 聯盟。

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