SnpEff: Sada nástrojů pro predikci variant genomických variant a funkčních efektů

  • Článek

SnpEff Sada nástrojů pro predikci efektů a anotaci genetických variant Anotuje a predikuje účinky genetických variant na geny a bílkoviny (například změny aminokyselin).

Další informace o datech najdete v uživatelské příručce.

Poznámka:

Microsoft poskytuje datové sady Azure Open Datasets na bázi "tak, jak je". Společnost Microsoft neposkytuje žádné záruky, výslovné ani předpokládané záruky ani podmínky týkající se vašeho používání datových sad. V rozsahu povoleném vaším místním zákonem společnost Microsoft odmítá veškerou odpovědnost za případné škody nebo ztráty, včetně přímých, následných, zvláštních, nepřímých, náhodných nebo represivních, vyplývajících z vašeho používání datových sad.

Na tuto datovou sadu se vztahují původní podmínky, které Microsoft přijal se zdrojovými daty. Datová sada může obsahovat data pocházející z Microsoftu.

Zdroj dat

Tato datová sada je zrcadlem http://downloads.sourceforge.net/project/snpeff/databases/.

Objemy dat a frekvence aktualizací

Tato datová sada obsahuje přibližně 2 TB dat a aktualizuje se každý měsíc.

Umístění úložiště

Tato datová sada se uchovává v těchto oblastech Azure: USA – středozápad a USA – západ 2. Kvůli přidružení se doporučuje přidělovat výpočetní prostředky v oblasti USA – středozápad nebo USA – západ 2.

Přístup k datům

USA – západ 2: 'https://datasetsnpeff.blob.core.windows.net/dataset'

USA – středozápad: 'https://datasetsnpeff-secondary.blob.core.windows.net/dataset'

Token SAS: sv=2019-10-10&st=2020-09-01T00%3A00%3A00Z&se=2050-09-01T00%3A00%3A00Z&si=prod&sr=c&sig=isafOa9tGnYBAvsXFUMDGMTbsG2z%2FShaihzp7JE5dHw%3D

Podmínky použití

Data jsou k dispozici bez omezení. Další informace a podrobnosti citace najdete v tématu Přístup k datům v ClinVar a jejich používání.

Kontakt

Pokud máte jakékoli dotazy nebo zpětnou vazbu k této datové sadě, obraťte se na Pablo Cingolani.

Další kroky

Prohlédněte si zbývající datové sady v katalogu Open Datasets.