Share via

OpenCravat: Öppna anpassad rangordnad analys av variantverktyg

  • Artikel

OpenCRAVAT är ett Python-paket som utför genomisk varianttolkning, inklusive variantpåverkan, anteckning och bedömning. OpenCRAVAT har en modulär arkitektur med ett stort utbud av analysmoduler och anteckningsresurser som kan väljas och installeras/köras baserat på en viss studies behov.

Mer information om data finns i OpenCravat.

Kommentar

Microsoft tillhandahåller Azure Open Datasets i befintligt fall. Microsoft ger inga garantier, uttryckliga eller underförstådda garantier eller villkor för din användning av datauppsättningarna. I den utsträckning som tillåts enligt din lokala lag frånsäger sig Microsoft allt ansvar för eventuella skador eller förluster, inklusive direkt, följdriktig, särskild, indirekt, tillfällig eller straffbar, till följd av din användning av datauppsättningarna.

Datamängden tillhandahålls enligt de ursprungliga villkor som gällde när Microsoft tog emot källdatan. Datamängden kan innehålla data från Microsoft.

Data source

Den här datamängden är en spegling av lagringen i https://store.opencravat.org och https://run.opencravat.org

Datavolymer och uppdateringsfrekvens

Den här datamängden innehåller 500 GB data och uppdateras dagligen.

Lagringsplats

Den här datamängden lagras i Azure-regionerna USA, västra 2 och USA, västra centrala. Vi rekommenderar att beräkningsresurser allokeras i USA, västra 2 eller USA, västra centrala av tillhörighetsskäl.

Dataåtkomst

USA, västra 2: 'https://datasetopencravat.blob.core.windows.net/dataset'

USA, västra centrala: "https://datasetopencravat-secondary.blob.core.windows.net/dataset"

SAS Token: sv=2020-04-08&st=2021-03-11T23%3A50%3A01Z&se=2025-07-26T22%3A50%3A00Z&sr=c&sp=rl&sig=J9J9wnJOXsmEy7TFMq9wjcxjXDE%2B7KhGpCUL4elsC14%3D

Användningsvillkor

OpenCRAVAT är tillgängligt med en GPLv3-licens. De flesta datakällor är kostnadsfria för icke-kommersiell användning. För kommersiell användning kan du se de institutionella kontakterna för varje datakälla.

Kontaktperson

rkarchi1@jhmi.edu

Nästa steg

Visa resten av datauppsättningarna i katalogen Öppna datamängder.