Share via

Öppna TCGA-data

  • Artikel

CancerGenome Atlas (TCGA), ett banbrytande cancergenomikprogram, som molekylärt karakteriserade över 20 000 primära cancerformer och matchade normala prover som omfattade 33 cancertyper[1]. TCGA-cancerdata som görs tillgängliga offentligt är två nivåer: öppen eller kontrollerad åtkomst.

  • Öppen åtkomst [tillgänglig i Azure]: Den här datamängden innehåller deindentifierade kliniska och biospecimen-data eller sammanfattade data som inte innehåller någon individuellt identifierbar information. De datatyper som ingår är Genuttryck, metylerings betavärden och proteinkvantifiering. Datatypen på DNA-nivå innehåller kopieringsnummer på gennivå och maskerat kopieringsnummersegment.
  • Kontrollerad åtkomst: Den här datamängden är sekvensdata på individuell nivå och kräver godkännande via dbGap för åtkomst.

Kommentar

Microsoft tillhandahåller Azure Open Datasets i befintligt fall. Microsoft ger inga garantier, uttryckliga eller underförstådda garantier eller villkor för din användning av datauppsättningarna. I den utsträckning som tillåts enligt din lokala lag frånsäger sig Microsoft allt ansvar för eventuella skador eller förluster, inklusive direkt, följdriktig, särskild, indirekt, tillfällig eller straffbar, till följd av din användning av datauppsättningarna.

Datamängden tillhandahålls enligt de ursprungliga villkor som gällde när Microsoft tog emot källdatan. Datamängden kan innehålla data från Microsoft.

Data source

Den här datamängden är en spegling av TCGA Open Data

Datavolymer och uppdateringsfrekvens

Den här datamängden innehåller cirka 387 GB

Lagringsplats

Den här datamängden lagras i Azure-regionerna USA, östra 2. Vi rekommenderar att beräkningsresurser tilldelas i USA, östra 2 av tillhörighetsskäl.

Dataåtkomst

USA, östra 2: 'https://datasettcga.blob.core.windows.net/dataset'

SAS-token: ?sp=rl&st=2022-10-07T19:43:37Z&se=2030-10-02T03:43:37Z&spr=https&sv=2021-06-08&sr=c&sig=9YgXjisOpHJNgdeMb5lOOzBhA38PWGM8g2DHjo9A5Cs%3D

Användningsvillkor 

Data är tillgängliga utan begränsningar. Mer information och citatinformation finns på sidan TCGA-program

Kontaktperson

För frågor om TCGA-data och program: https://www.cancer.gov/about-nci/organization/ccg/research/structural-genomics/tcga/contact

Nästa steg

Visa resten av datauppsättningarna i katalogen Öppna datamängder.