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使用 DICOM 服务的数字病理学

项目
05/21/2024

病理学中的数字成像提供了一种在实验室外共享图像、训练 AI/ML 模型和存储数字化显微镜幻灯片的方法。

为了带来这些好处，许多组织将整个幻灯片图像处理（WSI）数字幻灯片转换为 DICOM® 标准格式。图像采用 DICOM 格式后，可以将它们存储在商业可用的 PACS 系统中，这些系统可以使用常见的放射学工具和过程进行管理。

数字病理学的 DICOM 服务

DICOM 服务支持独特的数字病理要求，例如：

上传大小为多个 GB 的病理 DICOM 实例所需的规模和性能。
快速帧访问，使 Web 查看器能够顺利平移和缩放 DICOM 病理图像，且没有滞后或模糊。
存储图像长期诊断以用于存档和研究用途的经济高效方法。

数字化

尽管 DICOM 标准现在支持全幻灯片图像（WSI），但许多购置扫描程序不会以 DICOM 格式捕获图像。 DICOM 服务仅支持采用 DICOM 格式的图像，因此其他格式的 WSI 需要格式转换。存在一些商业和开源解决方案来执行这些格式转换。

下面是一些用于生成自己的转换器开放源代码工具的示例：

WSIDicomizer

存储

每个转换后的 WSI 都会生成一个包含多个实例的 DICOM 系列。

批量上传

考虑到需要上传的更大大小和实例数，我们建议使用 Import 批量上传每个系列或一批转换后的 WIS。

流式上传

如果要在转换时上传每个文件，请在示例中使用 STOW 单部分请求。

先决条件

curl -X POST \
    -H "Content-Type: application/dicom" \
    -H "Authorization: Bearer {token}" \
    -H "Accept: application/dicom+json" \
{service-url}/{version}/studies \
    --data-binary {dcmFile}.dcm

我们在几秒钟内测试了支持数十 GB 上传。

检索

查看者检索作为帧存储在 DICOM 实例中的磁贴。每个 DICOM 实例可以包含多个帧。建议使用并行单部分 GET 帧来提高性能。

先决条件

curl -X GET \
    -H "Authorization: Bearer {token}" \
    -H "Accept: application/octet-stream; transfer-syntax=*" \
{service-url}/{version}/studies/{studyInstanceUid}/series/{seriesInstanceUid}/instances/{sopInstanceUid}/frames/{frameNumber} \
    --output {fileName}

我们测试了 从客户端下载大约 60-70 毫秒 的 60Kb 磁贴。

查看员

建议使用任何可以使用 DICOMWeb 服务和 OIDC 身份验证配置的 WSI 查看器。

开源查看器示例：

如果查看器直接与 DICOM 服务交互，请遵循 CORS 准则。

查找 ISV 合作伙伴

dicom-support@microsoft.com如果你希望与我们的合作伙伴 ISV 合作，提供端到端解决方案和支持，请联系它。

后续步骤

在 Azure 中部署 DICOM 服务

将 DICOMweb API 与 DICOM 服务配合使用

注意

DICOM® 是美国电气制造商协会的注册商标，适用于其有关医疗信息数字通信的标准出版物。

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